www.wikidata.id-id.nina.az

Struktur kimia adalah suatu pemodelan struktur senyawa kimia yang memberikan informasi tentang bagaimana suatu atom yang

Struktur kimia

Struktur kimia adalah suatu pemodelan struktur senyawa kimia yang memberikan informasi tentang bagaimana suatu atom yang berbeda membentuk suatu molekul, atau agregat atom. Informasi ini termasuk geometri molekul, konfigurasi elektron dan, jika sesuai, struktur kristal.

Struktur molekul asam nitrat, memperlihatkan sudut dan ikatan.

Geometri molekul mengacu pada urutan spasial atom dalam molekul (termasuk panjang ikatan dan sudut ikatan) serta ikatan kimia yang memegang atom bersama-sama. Geometri molekul harus menjelaskan bentuk molekul paling sederhana seperti oksigen atau nitrogen, yang lebih kompleks, seperti molekul protein atau DNA. Dengan istilah ini kita juga bisa merujuk pada struktur di mana tidak ada molekul itu sendiri. Senyawa ionik atau kovalen tidak membentuk molekul namun membentuk jaringan tiga dimensi, agregat besar atom atau ion, dengan struktur reguler, simetris dan periodik.

Begitu struktur kimia dari suatu molekul dikenal atau diasumsikan, adalah mungkin untuk mewakilinya dengan menggunakan model bola molekuler seperti model bola-dan-pasak atau model ruang terisi.

Geometri molekul kovalen Sunting

Artikel utama: Geometri molekul

Pengaturan spasial atom dalam molekul tertentu adalah salah satu yang memungkinkan pembentukan ikatan antara atom-atom ini dengan tolakan sekecil apapun di antara awan elektron mereka, yang cenderung bergerak sejauh mungkin satu sama lain. Teori tolakan pasangan kulit elektron valensi (teori VSEPR) memberikan prediksi perkiraan bentuk atau struktur dari banyak molekul tunggal dari pasangan elektron bersama dan pasangan elektron bebas pada masing-masing atom pusat.

Geometri molekuler suatu senyawa kimia dapat digambarkan secara kasar oleh rumus struktur, dengan menggunakan model 2D dan 3D.

Konfigurasi elektron menggambarkan distribusi elektron atom antara tingkat dan sub-level energi yang berbeda serta pendudukan orbital molekul senyawa.

Geometri dan struktur molekul sederhana Sunting

Artikel utama: Teori VSEPR

Teori VSEPR memberikan pendekatan yang baik dari bentuk dan struktur banyak molekul, yang dilengkapi dengan input lain seperti teori hibridisasi atau teori orbital hibrida (OH).

Tabel di bawah menunjukkan beberapa molekul sederhana, dengan beberapa bentuk yang paling umum.

Molekul linear Molekul angular Molekul planar Molekul piramidal Molekul tetrahedral
Molekul karbonil sulfida, S=C=O Molekul air, H2O Molekul boron trifluorida, BF3, menunjukkan mode vibrasi Molekul tiotionil, S2F2 Molekul silikon tetrafluorida, SiF4
Dua ikatan rangkap dua 4 PE 3 PE 4 PE 4 PE

Jelas, ketika jumlah atom dalam molekul meningkat, kompleksitas strukturnya meningkat dan kesulitan penentuannya meningkat. Beberapa molekul yang strukturnya sulit ditentukan adalah sebagai berikut.

Benzena Heliks α (protein) DNA Hemoglobin
Kekulé (1865) Pauling dan Corey (1951) Watson dan Crick (1953) Max F. Perutz (1960)

Penentuan struktur kimia Sunting

Dalam menentukan struktur senyawa kimia, yang umumnya bertujuan untuk mendapatkan, minimal, pola dan multiplisitas ikatan antara semua atom dalam molekul; Bila mungkin, seseorang dapat mencari koordinat spasial tiga dimensi dari atom-atom di dalam molekul (atau zat padat lainnya). Metode yang dengannya seseorang dapat menjelaskan struktur dari sebuah molekul termasuk spektroskopi seperti resonansi magnetik nuklir (proton dan karbon-13 NMR), berbagai metode spektrometri massa (untuk memberikan massa molekul keseluruhan, serta fragmen massa), dan kristalografi sinar-x bila memungkinkan. Teknik terakhir bisa menghasilkan model tiga dimensi dengan resolusi resolusi resolusi optik, selama kristal tersedia. Ketika sebuah molekul memiliki spin elektron yang tidak berpasangan dalam gugus fungsional strukturnya, ENDOR dan spektroskopi resonansi spin elektron juga dapat dilakukan.

Teknik spektroskopi vibrasi, inframerah dan Raman, memberikan informasi pendukung penting mengenai jumlah dan kedekatan dari beberapa ikatan, dan mengenai jenis gugus fungsional (yang ikatan internalnya memberikan tanda vibrasi); studi inferensial lebih lanjut yang memberi wawasan tentang struktur elektronik molekul yang berkontribusi termasuk voltametri siklik dan spektroskopi fotoelektron sinar-X. Teknik yang terakhir ini menjadi lebih penting lagi bila molekul mengandung atom logam, dan bila kristal yang dibutuhkan kristalografi atau jenis atom spesifik yang dibutuhkan oleh NMR tidak tersedia untuk dieksploitasi dalam penentuan struktur. Akhirnya, metode yang lebih khusus seperti mikroskop elektron juga berlaku dalam beberapa kasus.

Lihat pula Sunting

Referensi Sunting

  1. ^ Chang, Raymond (2005). Kimia Dasar: Konsep-Konsep Inti Edisi Ketiga Jilid 1 (edisi ke-3rd). Jakarta: Erlangga. ISBN 979-781-039-9. 
  2. Palenik, G. J.; Jensen, W. P.; Suh, I. H. (2003). "The History of Molecular Structure Determination Viewed through the Nobel Prizes". J. Chem. Educ. 80 (7): 753. doi:10.1021/ed080p753. 
  3. James, P.; Quadroni, M.; Carafoli, E.; Gonnet, J. (1993). "Protein identification by mass profile fingerprinting". Biochem. Biophys. Res. Commun. 195: 58–64. doi:10.1006/bbrc.1993.2009. 
  4. Maxam, A. M.; Gilbert, W. (1977). "A new method for sequencing DNA". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 74: 560–64. doi:10.1073/pnas.74.2.560. 
  5. Hart, H.; Leslie, E. C.; David, J. H. (2003). Suminar Setiati Achmadi, ed. Organic Chemistry: A Short Course [Kimia Organik: Suatu Kuliah Singkat] (edisi ke-11th). Jakarta: Erlangga. ISBN 979-741-013-7. 
  6. Kekulé, August (1872). "Ueber einige Condensationsproducte des Aldehyds". Liebigs Ann. Chem. 162 (1): 77–124. doi:10.1002/jlac.18721620110. 
  7. Rocke, A. J. (1985). "Hypothesis and Experiment in the Early Development of Kekule's Benzene Theory". Annals of Science. 42 (4): 355–81. doi:10.1080/00033798500200411. 
  8. Pauling L, Corey RB, Branson HR (1951). "The structure of proteins: two hydrogen-bonded helical configurations of the polypeptide chain" (PDF). Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 37 (5): 235–40. Bibcode:1951PNAS...37..235P. doi:10.1073/pnas.37.5.235. PMC 1063348 . PMID 14834145. 
  9. Watson JD, Crick FH (April 1953). "Molecular structure of nucleic acids; a structure for deoxyribose nucleic acid" (PDF). Nature. 171 (4356): 737–8. Bibcode:1953Natur.171..737W. doi:10.1038/171737a0. PMID 13054692. 
  10. Perutz, M.F.; Rossmann, M.G.; Cullis, A.F.; Muirhead, H.; Will, G.; North, A.C.T. (1960). "Structure of haemoglobin: a three-dimensional Fourier synthesis at 5.5-A. resolution, obtained by X-ray analysis". Nature. 185 (4711): 416–22. Bibcode:1960Natur.185..416P. doi:10.1038/185416a0. PMID 18990801. 
  11. Perutz MF (1960). "Structure of haemoglobin". Brookhaven symposia in biology. 13: 165–83. PMID 13734651. 
  12. MacCallum, J. L.; et al. "Automatic Protein Structure Determination from Sparse NMR Spectroscopy Data". Biophys. J. 110 (3): 153a. doi:10.1016/j.bpj.2015.11.861. 
  13. Biemann, Klauss (2015). "Structure Determination of Natural Products by Mass Spectrometry". Annu. Rev. An. Chem. 8: 1–19. doi:10.1146/annurev-anchem-071114-040110. 
  14. Aebersold, R.; Mann, M. (2003). "Mass spectrometry-based proteomics". Nature. 422: 198–207. doi:10.1038/nature01511. 
  15. Pavia, D. L.; Lampman, G. M.; Kriz, G. S. (2001). Introduction to Spectroscopy a Guide for Students of Organic Chemistry (edisi ke-3rd). Philadelphia: Harcourt College Publishers. ISBN 978-003-058-427-5. OCLC 43859394. 
  16. Supratman, U. (2008). Elusidasi Struktur Senyawa Organik. Bandung: Widya Padjadjaran. ISBN 978-602-832-350-5. 
  17. Ho, P. J.; Starodub, D.; Saldin, D. K.; Shneerson, V. L.; Ourmazd, A.; Santra, R. (2009). "Molecular structure determination from x-ray scattering patterns of laser-aligned symmetric-top molecules". J. Chem. Phys. 131 (13). doi:10.1063/1.3245404. 
  18. Pavia, D. L.; Lampman, G. M.; Kriz, G. S.; Vyvyan, J. R. (2015). Introduction to Spectroscopy. Belmont: Cengage Learning. ISBN 978-128-546-012-3. OCLC 936352046. 

Bacaan lebih lanjut Sunting

  • Warren Gallagher, 2006, "Lecture 7: Structure Determination by X-ray Crystallography," dalam Chem 406: Biophysical Chemistry, self-published course notes, Eau Claire, WI, USA:University of Wisconsin-Eau Claire, Department of Chemistry, lihat [1], diakses tanggal 2 Juli 2014.
wikipedia, wiki, buku, buku, perpustakaan, artikel, baca, unduh, gratis, unduh gratis, mp3, video, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, gambar, musik, lagu, film, buku, permainan, permainan.
Tanggal penerbitan:
Struktur kimia adalah suatu pemodelan struktur senyawa kimia yang memberikan informasi tentang bagaimana suatu atom yang berbeda membentuk suatu molekul atau agregat atom Informasi ini termasuk geometri molekul konfigurasi elektron dan jika sesuai struktur kristal 1 2 Struktur molekul asam nitrat memperlihatkan sudut dan ikatan Geometri molekul mengacu pada urutan spasial atom dalam molekul termasuk panjang ikatan dan sudut ikatan serta ikatan kimia yang memegang atom bersama sama Geometri molekul harus menjelaskan bentuk molekul paling sederhana seperti oksigen atau nitrogen yang lebih kompleks seperti molekul protein atau DNA 3 4 Dengan istilah ini kita juga bisa merujuk pada struktur di mana tidak ada molekul itu sendiri Senyawa ionik atau kovalen tidak membentuk molekul namun membentuk jaringan tiga dimensi agregat besar atom atau ion dengan struktur reguler simetris dan periodik Begitu struktur kimia dari suatu molekul dikenal atau diasumsikan adalah mungkin untuk mewakilinya dengan menggunakan model bola molekuler seperti model bola dan pasak atau model ruang terisi 5 Molekul Atom Ion LogamAsam tioasetat CH3 COSH Intan Cn Tembaga I Iodida CuI2 LogamIkatan kovalen molekul Ikatan kovalen retikuler Ikatan ionik Ikatan logamDaftar isi 1 Geometri molekul kovalen 1 1 Geometri dan struktur molekul sederhana 2 Penentuan struktur kimia 3 Lihat pula 4 Referensi 5 Bacaan lebih lanjutGeometri molekul kovalen SuntingArtikel utama Geometri molekul Pengaturan spasial atom dalam molekul tertentu adalah salah satu yang memungkinkan pembentukan ikatan antara atom atom ini dengan tolakan sekecil apapun di antara awan elektron mereka yang cenderung bergerak sejauh mungkin satu sama lain Teori tolakan pasangan kulit elektron valensi teori VSEPR memberikan prediksi perkiraan bentuk atau struktur dari banyak molekul tunggal dari pasangan elektron bersama dan pasangan elektron bebas pada masing masing atom pusat 1 Geometri molekuler suatu senyawa kimia dapat digambarkan secara kasar oleh rumus struktur dengan menggunakan model 2D dan 3D Konfigurasi elektron menggambarkan distribusi elektron atom antara tingkat dan sub level energi yang berbeda serta pendudukan orbital molekul senyawa Geometri dan struktur molekul sederhana Sunting Artikel utama Teori VSEPR Teori VSEPR memberikan pendekatan yang baik dari bentuk dan struktur banyak molekul yang dilengkapi dengan input lain seperti teori hibridisasi atau teori orbital hibrida OH Tabel di bawah menunjukkan beberapa molekul sederhana dengan beberapa bentuk yang paling umum Molekul linear Molekul angular Molekul planar Molekul piramidal Molekul tetrahedral nbsp nbsp nbsp nbsp nbsp Molekul karbonil sulfida S C O Molekul air H2O Molekul boron trifluorida BF3 menunjukkan mode vibrasi Molekul tiotionil S2F2 Molekul silikon tetrafluorida SiF4Dua ikatan rangkap dua 4 PE 3 PE 4 PE 4 PEJelas ketika jumlah atom dalam molekul meningkat kompleksitas strukturnya meningkat dan kesulitan penentuannya meningkat Beberapa molekul yang strukturnya sulit ditentukan adalah sebagai berikut Benzena Heliks a protein DNA Hemoglobin nbsp nbsp nbsp nbsp Kekule 1865 6 7 Pauling dan Corey 1951 8 Watson dan Crick 1953 9 Max F Perutz 1960 10 11 Penentuan struktur kimia SuntingDalam menentukan struktur senyawa kimia yang umumnya bertujuan untuk mendapatkan minimal pola dan multiplisitas ikatan antara semua atom dalam molekul Bila mungkin seseorang dapat mencari koordinat spasial tiga dimensi dari atom atom di dalam molekul atau zat padat lainnya Metode yang dengannya seseorang dapat menjelaskan struktur dari sebuah molekul termasuk spektroskopi seperti resonansi magnetik nuklir proton dan karbon 13 NMR 12 berbagai metode spektrometri massa untuk memberikan massa molekul keseluruhan serta fragmen massa 13 14 dan kristalografi sinar x bila memungkinkan 15 16 Teknik terakhir bisa menghasilkan model tiga dimensi dengan resolusi resolusi resolusi optik selama kristal tersedia Ketika sebuah molekul memiliki spin elektron yang tidak berpasangan dalam gugus fungsional strukturnya ENDOR dan spektroskopi resonansi spin elektron juga dapat dilakukan 17 Teknik spektroskopi vibrasi inframerah dan Raman memberikan informasi pendukung penting mengenai jumlah dan kedekatan dari beberapa ikatan dan mengenai jenis gugus fungsional yang ikatan internalnya memberikan tanda vibrasi 18 studi inferensial lebih lanjut yang memberi wawasan tentang struktur elektronik molekul yang berkontribusi termasuk voltametri siklik dan spektroskopi fotoelektron sinar X Teknik yang terakhir ini menjadi lebih penting lagi bila molekul mengandung atom logam dan bila kristal yang dibutuhkan kristalografi atau jenis atom spesifik yang dibutuhkan oleh NMR tidak tersedia untuk dieksploitasi dalam penentuan struktur Akhirnya metode yang lebih khusus seperti mikroskop elektron juga berlaku dalam beberapa kasus Lihat pula Sunting nbsp Portal Kimia Diagram struktur kimia Asas larangan Pauli Prinsip Aufbau Kaidah oktet KristalografiReferensi Sunting a b Chang Raymond 2005 Kimia Dasar Konsep Konsep Inti Edisi Ketiga Jilid 1 edisi ke 3rd Jakarta Erlangga ISBN 979 781 039 9 Palenik G J Jensen W P Suh I H 2003 The History of Molecular Structure Determination Viewed through the Nobel Prizes J Chem Educ 80 7 753 doi 10 1021 ed080p753 Pemeliharaan CS1 Banyak nama authors list link James P Quadroni M Carafoli E Gonnet J 1993 Protein identification by mass profile fingerprinting Biochem Biophys Res Commun 195 58 64 doi 10 1006 bbrc 1993 2009 Pemeliharaan CS1 Banyak nama authors list link Maxam A M Gilbert W 1977 A new method for sequencing DNA Proc Natl Acad Sci USA 74 560 64 doi 10 1073 pnas 74 2 560 Pemeliharaan CS1 Banyak nama authors list link Hart H Leslie E C David J H 2003 Suminar Setiati Achmadi ed Organic Chemistry A Short Course Kimia Organik Suatu Kuliah Singkat edisi ke 11th Jakarta Erlangga ISBN 979 741 013 7 Pemeliharaan CS1 Banyak nama authors list link Kekule August 1872 Ueber einige Condensationsproducte des Aldehyds Liebigs Ann Chem 162 1 77 124 doi 10 1002 jlac 18721620110 Rocke A J 1985 Hypothesis and Experiment in the Early Development of Kekule s Benzene Theory Annals of Science 42 4 355 81 doi 10 1080 00033798500200411 Pauling L Corey RB Branson HR 1951 The structure of proteins two hydrogen bonded helical configurations of the polypeptide chain PDF Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 37 5 235 40 Bibcode 1951PNAS 37 235P doi 10 1073 pnas 37 5 235 PMC 1063348 nbsp PMID 14834145 Watson JD Crick FH April 1953 Molecular structure of nucleic acids a structure for deoxyribose nucleic acid PDF Nature 171 4356 737 8 Bibcode 1953Natur 171 737W doi 10 1038 171737a0 PMID 13054692 Perutz M F Rossmann M G Cullis A F Muirhead H Will G North A C T 1960 Structure of haemoglobin a three dimensional Fourier synthesis at 5 5 A resolution obtained by X ray analysis Nature 185 4711 416 22 Bibcode 1960Natur 185 416P doi 10 1038 185416a0 PMID 18990801 Perutz MF 1960 Structure of haemoglobin Brookhaven symposia in biology 13 165 83 PMID 13734651 MacCallum J L et al Automatic Protein Structure Determination from Sparse NMR Spectroscopy Data Biophys J 110 3 153a doi 10 1016 j bpj 2015 11 861 Pemeliharaan CS1 Penggunaan et al yang eksplisit link Biemann Klauss 2015 Structure Determination of Natural Products by Mass Spectrometry Annu Rev An Chem 8 1 19 doi 10 1146 annurev anchem 071114 040110 Aebersold R Mann M 2003 Mass spectrometry based proteomics Nature 422 198 207 doi 10 1038 nature01511 Pemeliharaan CS1 Banyak nama authors list link Pavia D L Lampman G M Kriz G S 2001 Introduction to Spectroscopy a Guide for Students of Organic Chemistry edisi ke 3rd Philadelphia Harcourt College Publishers ISBN 978 003 058 427 5 OCLC 43859394 Pemeliharaan CS1 Banyak nama authors list link Supratman U 2008 Elusidasi Struktur Senyawa Organik Bandung Widya Padjadjaran ISBN 978 602 832 350 5 Ho P J Starodub D Saldin D K Shneerson V L Ourmazd A Santra R 2009 Molecular structure determination from x ray scattering patterns of laser aligned symmetric top molecules J Chem Phys 131 13 doi 10 1063 1 3245404 Pemeliharaan CS1 Banyak nama authors list link Pavia D L Lampman G M Kriz G S Vyvyan J R 2015 Introduction to Spectroscopy Belmont Cengage Learning ISBN 978 128 546 012 3 OCLC 936352046 Pemeliharaan CS1 Banyak nama authors list link Bacaan lebih lanjut SuntingWarren Gallagher 2006 Lecture 7 Structure Determination by X ray Crystallography dalam Chem 406 Biophysical Chemistry self published course notes Eau Claire WI USA University of Wisconsin Eau Claire Department of Chemistry lihat 1 diakses tanggal 2 Juli 2014 Diperoleh dari https id wikipedia org w index php title Struktur kimia amp oldid 22226225