www.wikidata.id-id.nina.az

DrugBank merupakan basis data daring yang komprehensif dan dapat diakses secara bebas yang berisi informasi tentang obat

DrugBank

DrugBank merupakan basis data daring yang komprehensif dan dapat diakses secara bebas yang berisi informasi tentang obat dan target obat. Baik sebagai sumber bioinformatika dan informatika kimia, DrugBank menggabungkan rincian mengenai data obat (yaitu sifat kimia, farmakologi dan farmasi) dengan informasi dari target obat (yaitu urutan, struktur, dan jalur) secara komprehensif. Karena cakupannya yang luas, referensi yang komprehensif dan deskripsi data yang luar biasa rinci, DrugBank lebih mencerminkan sebuah ensiklopedia obat dibanding basis data obat. Akibatnya, pranala ke DrugBank dikelola untuk hampir semua obat yang tercantum dalam Wikipedia. DrugBank banyak digunakan oleh industri obat, ahli kimia obat, apoteker, dokter, mahasiswa dan masyarakat umum. Luasnya data obat dan target obat drug and drug-target data telah memungkinkan penemuan dan pengajuan kembali sejumlah obat yang ada untuk mengobati penyakit langka dan baru diidentifikasi.

DrugBank
Konten
DeskripsiBasis data obat
Jenis dataStruktur kimia, molekul obat kecil, obat bioteknologi, target obat, transporter obat, urutan target obat, target obat SNP, metabolit obat, deskripsi obat, asosiasi penyakit, data dosis, interaksi makanan dan obat, efek samping obat, farmakologi, mekanisme kerja, metabolisme obat, sintesis kimia, paten data dan harga, sifat kimia, tata nama, sinonim, taksonomi kimia, spektrum NMR obat, spektrum GC-MS obat, spektrum LC-MS obat
Kontak
Pusat penelitianUniversity of Alberta and The Metabolomics Innovation Centre
LaboratoriumDr. David Wishart
Akses
Situs webwww.drugbank.ca
URL pengunduhanwww.drugbank.ca/downloads
Perangkat
Lain-lain
Frekuensi rilis dataSetiap 2 tahun dengan koreksi bulanan dan pembaruan
Kebijakan kurasiSecara manual dikuratori

Rilis terbaru basis data (versi 5.0) berisi 8227 entri obat termasuk 2003 obat molekul kecil yang disetujui oleh FDA, 221 obat bioteknologi (protein/peptida) yang disetujui-FDA, 93 nutraseutikal dan lebih dari 6000 obat percobaan. Selain itu, sekuens 4270 protein non-redundan (yaitu target obat /enzim/transporter/pembawa) dihubungkan dengan entri obat tersebut.


Setiap entri DrugCard berisi lebih dari 200 bidang data dengan setengah dari informasi yang ditujukan untuk data kimia/obat dan setengah lainnya yang ditujukan untuk data target obat atau protein.

Empat basis data tambahan, HMDB, T3DB, SMPDB dan FooDB juga merupakan bagian dari Suite umum basis data metabolomika/informatika kimia. HMDB berisi informasi setara dengan lebih dari 40.000 metabolit manusia, T3DB berisi informasi tentang 3100 racun umum dan polutan lingkungan, SMPDB berisi diagram jalur untuk hampir 700 jalur metabolisme manusia dan jalur penyakit, sementara FooDB berisi setara dengan informasi mengenai ~28.000 komponen makanan dan aditif makanan.

Sejarah Sunting

Versi pertama dari DrugBank dirilis pada tahun 2006. Rilis awal ini berisi informasi yang relatif sederhana tentang 841 obat molekul kecil dan 113 obat bioteknologi yang disetujui oleh FDA. Ini juga termasuk informasi mengenai 2133 target obat. Versi kedua dari DrugBank dirilis pada tahun 2009. Versi basis data ini sangat diperluas dan ditingkatkan termasuk 1344 obat molekul kecil dan 123 obat bioteknologi yang disetujui serta 3037 target obat yang unik. Versi 2.0 juga termasuk, untuk pertama kalinya, obat yang ditarik dan obat terlarang, interaksi yang luas antara makanan-obat dan obat-obat serta parameter ADMET (penyerapan, distribusi, metabolisme, ekskresi dan toksisitas). Versi 3.0 dirilis pada tahun 2011. Versi ini terdapat 1424 obat molekul kecil dan 132 obat bioteknologi yang disetujui serta >4000 target obat yang unik. Versi 3.0 juga termasuk data transporter obat, data jalur obat, harga obat, data paten dan manufaktur serta data pada >5000 obat percobaan. Versi 4.0 dirilis pada tahun 2014. Versi ini termasuk di antaranya 1.558 obat molekul kecil, 155 obat bioteknologi dan 4200 target obat unik yang disetujui oleh FDA. Versi 4.0 juga menggabungkan informasi lengkap tentang metabolit obat (struktur dan reaksi), taksonomi obat, spektrum obat, konstanta pengikatan obat dan informasi sintesis obat.

Lihat pula Sunting

Wikidata memiliki sebuah properti, P715, untuk DrugBank (lihat penggunaan)

Referensi Sunting

  1. ^ Wishart, DS; Knox C; Guo AC; et al. (Jan 2006). "DrugBank: a comprehensive resource for in silico drug discovery and exploration". Nucleic Acids Research. 34 (Database issue): D668-D672. doi:10.1093/nar/gkj067. PMC 1347430 . PMID 16381955. 
  2. ^ Wishart, DS; Knox C; Guo AC; et al. (Jan 2008). "DrugBank: a knowledgebase for drugs, drug actions and drug targets". Nucleic Acids Research. 36 (Database issue): D901–906. doi:10.1093/nar/gkm958. PMC 2238889 . PMID 18048412. 
  3. ^ Law, V; Knox, C; Djoumbou, Y; Jewison, T; Guo, AC; Liu, Y; Maciejewski, A; Arndt, D; Wilson, M; Neveu, V; Tang, A; Gabriel, G; Ly, C; Adamjee, S; Dame, ZT; Han, B; Zhou, Y; Wishart, DS (Jan 2014). "DrugBank 5.0: shedding new light on drug metabolism". Nucleic Acids Research. 42 (Database issue): D1091-7. doi:10.1093/nar/gkt1068. PMC 3965102 . PMID 24203711. 
  4. Wishart, DS; Guo, AC; Eisner, R; Young, N; Gautam, B; Hau, DD; Psychogios, N; Dong, E; Bouatra, S; Mandal, R; Sinelnikov, I; Xia, J; Jia, L; Cruz, JA; Lim, E; Sobsey, CA; Shrivastava, S; Huang, P; Liu, P; Fang, L; Peng, J; Fradette, R; Cheng, D; Tzur, D; Clements, M; Lewis, A; De Souza, A; Zuniga, A; Dawe, M; Xiong, Y; Clive, D; Greiner, R; Nazyrova, A; Shaykhutdinov, R; Li, L; Vogel, HJ; Forsythe, I (Jan 2009). "HMDB: a knowledgebase for the human metabolome". Nucleic Acids Research. 37 (Database issue): D603-10. doi:10.1093/nar/gkn810. PMC 2686599 . PMID 18953024. 
  5. Lim, E; Pon A; Djoumbou Y; Knox C; Shrivastava S; Guo AC; Neveu V; Wishart DS. (Jan 2010). "T3DB: a comprehensively annotated database of common toxins and their targets". Nucleic Acids Research. 38 (Database issue): D781-6. doi:10.1093/nar/gkp934. PMC 2808899 . PMID 19897546. 
  6. Jewison, T; Su Y; Disfany FM; et al. (Jan 2014). "Small Molecule Pathway Database". Nucleic Acids Research. 42 (Database issue): D478-84. doi:10.1093/nar/gkt1067. PMC 3965088 . PMID 24203708. 
  7. Knox, C; Law, V; Jewison, T; Liu, P; Ly, S; Frolkis, A; Pon, A; Banco, K; Mak, C; Neveu, V; Djoumbou, Y; Eisner, R; Guo, AC; Wishart, DS. (Jan 2011). "DrugBank 3.0: a comprehensive resource for 'omics' research on drugs". Nucleic Acids Research. 39 (Database issue): D1035–41. doi:10.1093/nar/gkq1126. PMC 3013709 . PMID 21059682. 

Pranala luar Sunting

wikipedia, wiki, buku, buku, perpustakaan, artikel, baca, unduh, gratis, unduh gratis, mp3, video, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, gambar, musik, lagu, film, buku, permainan, permainan.
Tanggal penerbitan:
DrugBank merupakan basis data daring yang komprehensif dan dapat diakses secara bebas yang berisi informasi tentang obat dan target obat 1 Baik sebagai sumber bioinformatika dan informatika kimia DrugBank menggabungkan rincian mengenai data obat yaitu sifat kimia farmakologi dan farmasi dengan informasi dari target obat yaitu urutan struktur dan jalur secara komprehensif 1 2 Karena cakupannya yang luas referensi yang komprehensif dan deskripsi data yang luar biasa rinci DrugBank lebih mencerminkan sebuah ensiklopedia obat dibanding basis data obat Akibatnya pranala ke DrugBank dikelola untuk hampir semua obat yang tercantum dalam Wikipedia DrugBank banyak digunakan oleh industri obat ahli kimia obat apoteker dokter mahasiswa dan masyarakat umum Luasnya data obat dan target obat drug and drug target data telah memungkinkan penemuan dan pengajuan kembali sejumlah obat yang ada untuk mengobati penyakit langka dan baru diidentifikasi DrugBankKontenDeskripsiBasis data obatJenis dataStruktur kimia molekul obat kecil obat bioteknologi target obat transporter obat urutan target obat target obat SNP metabolit obat deskripsi obat asosiasi penyakit data dosis interaksi makanan dan obat efek samping obat farmakologi mekanisme kerja metabolisme obat sintesis kimia paten data dan harga sifat kimia tata nama sinonim taksonomi kimia spektrum NMR obat spektrum GC MS obat spektrum LC MS obatKontakPusat penelitianUniversity of Alberta and The Metabolomics Innovation CentreLaboratoriumDr David WishartAksesSitus webwww wbr drugbank wbr caURL pengunduhanwww wbr drugbank wbr ca wbr downloadsPerangkatLain lainFrekuensi rilis dataSetiap 2 tahun dengan koreksi bulanan dan pembaruanKebijakan kurasiSecara manual dikuratoriRilis terbaru basis data versi 5 0 berisi 8227 entri obat termasuk 2003 obat molekul kecil yang disetujui oleh FDA 221 obat bioteknologi protein peptida yang disetujui FDA 93 nutraseutikal dan lebih dari 6000 obat percobaan 3 Selain itu sekuens 4270 protein non redundan yaitu target obat enzim transporter pembawa dihubungkan dengan entri obat tersebut Setiap entri DrugCard berisi lebih dari 200 bidang data dengan setengah dari informasi yang ditujukan untuk data kimia obat dan setengah lainnya yang ditujukan untuk data target obat atau protein 3 Empat basis data tambahan HMDB 4 T3DB 5 SMPDB 6 dan FooDB juga merupakan bagian dari Suite umum basis data metabolomika informatika kimia HMDB berisi informasi setara dengan lebih dari 40 000 metabolit manusia T3DB berisi informasi tentang 3100 racun umum dan polutan lingkungan SMPDB berisi diagram jalur untuk hampir 700 jalur metabolisme manusia dan jalur penyakit sementara FooDB berisi setara dengan informasi mengenai 28 000 komponen makanan dan aditif makanan Daftar isi 1 Sejarah 2 Lihat pula 3 Referensi 4 Pranala luarSejarah SuntingVersi pertama dari DrugBank dirilis pada tahun 2006 1 Rilis awal ini berisi informasi yang relatif sederhana tentang 841 obat molekul kecil dan 113 obat bioteknologi yang disetujui oleh FDA Ini juga termasuk informasi mengenai 2133 target obat Versi kedua dari DrugBank dirilis pada tahun 2009 2 Versi basis data ini sangat diperluas dan ditingkatkan termasuk 1344 obat molekul kecil dan 123 obat bioteknologi yang disetujui serta 3037 target obat yang unik Versi 2 0 juga termasuk untuk pertama kalinya obat yang ditarik dan obat terlarang interaksi yang luas antara makanan obat dan obat obat serta parameter ADMET penyerapan distribusi metabolisme ekskresi dan toksisitas Versi 3 0 dirilis pada tahun 2011 7 Versi ini terdapat 1424 obat molekul kecil dan 132 obat bioteknologi yang disetujui serta gt 4000 target obat yang unik Versi 3 0 juga termasuk data transporter obat data jalur obat harga obat data paten dan manufaktur serta data pada gt 5000 obat percobaan Versi 4 0 dirilis pada tahun 2014 3 Versi ini termasuk di antaranya 1 558 obat molekul kecil 155 obat bioteknologi dan 4200 target obat unik yang disetujui oleh FDA Versi 4 0 juga menggabungkan informasi lengkap tentang metabolit obat struktur dan reaksi taksonomi obat spektrum obat konstanta pengikatan obat dan informasi sintesis obat Lihat pula Sunting nbsp Wikidata memiliki sebuah properti P715 untuk DrugBank lihat penggunaan ChEMBL ChEBI ChemSpider Farmakologi PubChem SMPDB SMILES T3DBReferensi Sunting a b c Wishart DS Knox C Guo AC et al Jan 2006 DrugBank a comprehensive resource for in silico drug discovery and exploration Nucleic Acids Research 34 Database issue D668 D672 doi 10 1093 nar gkj067 PMC 1347430 nbsp PMID 16381955 a b Wishart DS Knox C Guo AC et al Jan 2008 DrugBank a knowledgebase for drugs drug actions and drug targets Nucleic Acids Research 36 Database issue D901 906 doi 10 1093 nar gkm958 PMC 2238889 nbsp PMID 18048412 a b c Law V Knox C Djoumbou Y Jewison T Guo AC Liu Y Maciejewski A Arndt D Wilson M Neveu V Tang A Gabriel G Ly C Adamjee S Dame ZT Han B Zhou Y Wishart DS Jan 2014 DrugBank 5 0 shedding new light on drug metabolism Nucleic Acids Research 42 Database issue D1091 7 doi 10 1093 nar gkt1068 PMC 3965102 nbsp PMID 24203711 Wishart DS Guo AC Eisner R Young N Gautam B Hau DD Psychogios N Dong E Bouatra S Mandal R Sinelnikov I Xia J Jia L Cruz JA Lim E Sobsey CA Shrivastava S Huang P Liu P Fang L Peng J Fradette R Cheng D Tzur D Clements M Lewis A De Souza A Zuniga A Dawe M Xiong Y Clive D Greiner R Nazyrova A Shaykhutdinov R Li L Vogel HJ Forsythe I Jan 2009 HMDB a knowledgebase for the human metabolome Nucleic Acids Research 37 Database issue D603 10 doi 10 1093 nar gkn810 PMC 2686599 nbsp PMID 18953024 Lim E Pon A Djoumbou Y Knox C Shrivastava S Guo AC Neveu V Wishart DS Jan 2010 T3DB a comprehensively annotated database of common toxins and their targets Nucleic Acids Research 38 Database issue D781 6 doi 10 1093 nar gkp934 PMC 2808899 nbsp PMID 19897546 Jewison T Su Y Disfany FM et al Jan 2014 Small Molecule Pathway Database Nucleic Acids Research 42 Database issue D478 84 doi 10 1093 nar gkt1067 PMC 3965088 nbsp PMID 24203708 Knox C Law V Jewison T Liu P Ly S Frolkis A Pon A Banco K Mak C Neveu V Djoumbou Y Eisner R Guo AC Wishart DS Jan 2011 DrugBank 3 0 a comprehensive resource for omics research on drugs Nucleic Acids Research 39 Database issue D1035 41 doi 10 1093 nar gkq1126 PMC 3013709 nbsp PMID 21059682 Pranala luar SuntingSitus web resmi URL pengunduhan DrugBank Diperoleh dari https id wikipedia org w index php title DrugBank amp oldid 23348568