www.wikidata.id-id.nina.az

International Chemical Identifier IUPAC InChI merupakan suatu identifier tekstual untuk bahan kimia didesain sebagai sta

International Chemical Identifier

IUPAC International Chemical Identifier (InChI) merupakan suatu identifier tekstual untuk bahan kimia, didesain sebagai standar dan cara pembacaan manusia untuk pengkodean informasi molekuler dan untuk membantu riset informasi tersebut dalam database dan web. Awalnya dikembangkan oleh IUPAC dan NIST selama tahun 2000–2005, format dan algoritmenya non-proprietary. Perkembangan selanjutnya standar ini telah didukung sejak tahun 2010 oleh yayasan nirlaba InChI Trust, di mana IUPAC adalah salah satu anggotanya. Versi terakhir adalah 1.04 yang dirilis pada bulan September 2011.

InChI
PengembangInChI Trust
Rilis perdana15 April 2005 (2005-04-15)
Rilis stabil
1.04 / September 2011; 12 tahun lalu (2011-09)
Sistem operasiMicrosoft Windows and Unix-like
PlatformIA-32 and x86-64
Ukuran4.3 MB
Tersedia dalamInggris
LisensiIUPAC / InChI Trust Licence
Situs webhttp://www.iupac.org/home/publications/e-resources/inchi.html

Format dan lapisan Sunting

InChI format
Jenis MIMEchemical/x-inchi
Jenis formatformat berkas kimia

Setiap InChI dimulai dengan suatu string "InChI=" diikuti oleh nomor versi, saat ini "1". Ini diikuti oleh huruf "S" untuk "standard InChI". Informasi selebihnya disusun dalam struktur urutan lapisan (layer) dan sub-lapisan (sub-layer), di mana setiap lapisan memberikan satu jenis informasi tertentu. Lapisan-lapisan dan sub-lapisannya dipisahkan oleh delimiter "/" dan diawali dengan suatu huruf awalan khas (kecuali sub-lapisan rumus kimia dari lapisan utama). Enam lapisan dengan sub-lapisan penting adalah:

  1. Lapisan utama (Main layer)
    • Rumus kimia (tanpa awalan). Ini satu-satunya sub-layer yang harus ada pada setiap InChI.
    • Hubungan atom (awalan: "c" untuk "connection"). Atom-atom dalam rumus kimia (kecuali hidrogen) diberi nomor urut; sublayer ini memaparkan atom mana yang dihubungkan dengan ikatan-ikatan ke atom yang lain.
    • Atom Hidrogen (awalan: "h"). Memaparkan berapa atom hidrogen yang dihubungkan dengan masing-masing atom lain.
  2. Lapisan muatan
    • sublayer proton (awalan: "p" untuk "proton")
    • sublayer muatan ("charge"; awalan: "q")
  3. Lapisan stereokimia
    • ikatan ganda dan cumulene (awalan: "b")
    • tetrahedral stereochemistry atom-atom dan alena/allene (awalan: "t", "m")
    • jenis informasi stereokimia (awalan: "s")
  4. Isotopic layer (awalan: "i", "h", juga "b", "t", "m", "s" untuk stereokimia isotop)
  5. Fixed-H layer (awalan: "f"); contains some or all of the above types of layers except atom connections; may end with "o" sublayer; never included in standard InChI
  6. Reconnected layer (awalan: "r"); contains the whole InChI of a structure with reconnected metal atoms; never included in standard InChI

Format awalan-delimiter mempunyai keuntungan yaitu memudahkan pengguna memakai pencarian wildcard dalam menemukan identifier yang cocok hanya pada lapisan-lapisan tertentu.

Contoh Sunting

CH3CH2OH
etanol 		InChI=1/C2H6O/c1-2-3/h3H,2H2,1H3

InChI=1S/C2H6O/c1-2-3/h3H,2H2,1H3 (standard InChI)


L-asam askorbat 		InChI=1/C6H8O6/c7-1-2(8)5-3(9)4(10)6(11)12-5/h2,5,7-10H,1H2/t2-,5+/m0/s1

InChI=1S/C6H8O6/c7-1-2(8)5-3(9)4(10)6(11)12-5/h2,5,7-8,10-11H,1H2/t2-,5+/m0/s1 (standard InChI)

Pengadopsian Sunting

InChI telah diadopsi oleh banyak database besar dan kecil, termasuk ChemSpider dan PubChem. Namun, pengambilan ini tidak secara langsung, dan banyak database menunjukkan diskrepansi antara struktur kimia dan InChI yang dimuat, sehingga merupakan masalah bagi pengkaitan database.

lihat pula Sunting

  • Molecular Query Language
  • Simplified molecular-input line-entry system (SMILES)
  • Molecule editor
  • SYBYL Line Notation

Referensi Sunting

  1. . IUPAC. Diarsipkan dari versi asli tanggal 2012-05-27. Diakses tanggal 5 December 2012. 
  2. DOI:10.1186/1758-2946-5-7
    Rujukan ini akan diselesaikan secara otomatis dalam beberapa menit. Anda dapat melewati antrian atau membuat secara manual
  3. DOI:10.1186/1758-2946-4-35
    Rujukan ini akan diselesaikan secara otomatis dalam beberapa menit. Anda dapat melewati antrian atau membuat secara manual

Pranala luar Sunting

Wikidata memiliki sebuah properti, P234, untuk International Chemical Identifiers (lihat penggunaan)

Dokumentasi dan presentasi Sunting

Software dan servis Sunting

  • NCI/CADD Chemical Identifier Resolver Generates and resolves InChI/InChIKeys and many other chemical identifiers
  • ChemSpider InChI resolver
  • Search Google for molecules 2006-01-17 di Wayback Machine. (generates InChI from interactive chemical and searches Google for any pages with embedded InChIs). Requires Javascript enabled on browser
  • ChemSketch 2006-10-18 di Wayback Machine., free chemical structure drawing package that includes input and output in InCHI format
  • PubChem online molecule editor that supports SMILES/SMARTS and InChI
  • ChemSpider Services that allows generation of InChI and conversion of InChI to structure (also SMILES and generation of other properties)
  • MarvinSketch 2007-04-04 di Wayback Machine. from ChemAxon, implementation to draw structures (or open other file formats) and output to InChI file format
  • BKchem 2007-06-09 di Wayback Machine. implements its own InChI parser and uses the IUPAC implementation to generate InChI strings
  • CompoundSearch implements an InChI and InChI Key search of spectral libraries
  • JNI-InChI Java library that wraps the InChI library
  • the Chemistry Development Kit uses JNI-InChI to generate InChIs, can convert InChIs into structures, and generate tautomers based on the InChI algorithms
  • Bioclipse generates InChI and InChIKeys for drawn structures or opened files
wikipedia, wiki, buku, buku, perpustakaan, artikel, baca, unduh, gratis, unduh gratis, mp3, video, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, gambar, musik, lagu, film, buku, permainan, permainan.
Tanggal penerbitan:
IUPAC International Chemical Identifier InChI merupakan suatu identifier tekstual untuk bahan kimia didesain sebagai standar dan cara pembacaan manusia untuk pengkodean informasi molekuler dan untuk membantu riset informasi tersebut dalam database dan web Awalnya dikembangkan oleh IUPAC dan NIST selama tahun 2000 2005 format dan algoritmenya non proprietary Perkembangan selanjutnya standar ini telah didukung sejak tahun 2010 oleh yayasan nirlaba InChI Trust di mana IUPAC adalah salah satu anggotanya Versi terakhir adalah 1 04 yang dirilis pada bulan September 2011 InChIPengembangInChI TrustRilis perdana15 April 2005 2005 04 15 1 2 Rilis stabil1 04 September 2011 12 tahun lalu 2011 09 Sistem operasiMicrosoft Windows and Unix likePlatformIA 32 and x86 64Ukuran4 3 MBTersedia dalamInggrisLisensiIUPAC InChI Trust LicenceSitus webhttp www iupac org home publications e resources inchi html Daftar isi 1 Format dan lapisan 2 Contoh 3 Pengadopsian 4 lihat pula 5 Referensi 6 Pranala luar 6 1 Dokumentasi dan presentasi 6 2 Software dan servisFormat dan lapisan SuntingInChI formatJenis MIMEchemical x inchiJenis formatformat berkas kimiaSetiap InChI dimulai dengan suatu string InChI diikuti oleh nomor versi saat ini 1 Ini diikuti oleh huruf S untuk standard InChI Informasi selebihnya disusun dalam struktur urutan lapisan layer dan sub lapisan sub layer di mana setiap lapisan memberikan satu jenis informasi tertentu Lapisan lapisan dan sub lapisannya dipisahkan oleh delimiter dan diawali dengan suatu huruf awalan khas kecuali sub lapisan rumus kimia dari lapisan utama Enam lapisan dengan sub lapisan penting adalah Lapisan utama Main layer Rumus kimia tanpa awalan Ini satu satunya sub layer yang harus ada pada setiap InChI Hubungan atom awalan c untuk connection Atom atom dalam rumus kimia kecuali hidrogen diberi nomor urut sublayer ini memaparkan atom mana yang dihubungkan dengan ikatan ikatan ke atom yang lain Atom Hidrogen awalan h Memaparkan berapa atom hidrogen yang dihubungkan dengan masing masing atom lain Lapisan muatan sublayer proton awalan p untuk proton sublayer muatan charge awalan q Lapisan stereokimia ikatan ganda dan cumulene awalan b tetrahedral stereochemistry atom atom dan alena allene awalan t m jenis informasi stereokimia awalan s Isotopic layer awalan i h juga b t m s untuk stereokimia isotop Fixed H layer awalan f contains some or all of the above types of layers except atom connections may end with o sublayer never included in standard InChI Reconnected layer awalan r contains the whole InChI of a structure with reconnected metal atoms never included in standard InChIFormat awalan delimiter mempunyai keuntungan yaitu memudahkan pengguna memakai pencarian wildcard dalam menemukan identifier yang cocok hanya pada lapisan lapisan tertentu Contoh SuntingCH3CH2OHetanol InChI 1 C2H6O c1 2 3 h3H 2H2 1H3InChI 1S C2H6O c1 2 3 h3H 2H2 1H3 standard InChI nbsp L asam askorbat InChI 1 C6H8O6 c7 1 2 8 5 3 9 4 10 6 11 12 5 h2 5 7 10H 1H2 t2 5 m0 s1InChI 1S C6H8O6 c7 1 2 8 5 3 9 4 10 6 11 12 5 h2 5 7 8 10 11H 1H2 t2 5 m0 s1 standard InChI Pengadopsian SuntingInChI telah diadopsi oleh banyak database besar dan kecil termasuk ChemSpider dan PubChem Namun pengambilan ini tidak secara langsung dan banyak database menunjukkan diskrepansi antara struktur kimia dan InChI yang dimuat sehingga merupakan masalah bagi pengkaitan database 3 lihat pula SuntingMolecular Query Language Simplified molecular input line entry system SMILES Molecule editor SYBYL Line NotationReferensi Sunting IUPAC International Chemical Identifier Project Page IUPAC Diarsipkan dari versi asli tanggal 2012 05 27 Diakses tanggal 5 December 2012 DOI 10 1186 1758 2946 5 7Rujukan ini akan diselesaikan secara otomatis dalam beberapa menit Anda dapat melewati antrian atau membuat secara manual DOI 10 1186 1758 2946 4 35Rujukan ini akan diselesaikan secara otomatis dalam beberapa menit Anda dapat melewati antrian atau membuat secara manualPranala luar Sunting nbsp Wikidata memiliki sebuah properti P234 untuk International Chemical Identifiers lihat penggunaan Dokumentasi dan presentasi Sunting InChI Trust site IUPAC InChI site Unofficial InChI FAQ Diarsipkan 2012 03 06 di Wayback Machine 335 KB PDF 1 Description of the canonicalization algorithm Googling for InChIs a presentation to the W3C The Semantic Chemical Web GoogleInChI and other Mashups Diarsipkan 2012 03 27 di Wayback Machine Google Tech Talk by Peter Murray Rust 13 Sept 2006 IUPAC InChI Diarsipkan 2011 11 25 di Wayback Machine Google Tech Talk by Steve Heller and Steve Stein 2 November 2006 InChI Release 1 02 Diarsipkan 2010 03 30 di Wayback Machine InChI final version 1 02 and explanation of Standard InChI January 2009Software dan servis Sunting NCI CADD Chemical Identifier Resolver Generates and resolves InChI InChIKeys and many other chemical identifiers ChemSpider InChI resolver Search Google for molecules Diarsipkan 2006 01 17 di Wayback Machine generates InChI from interactive chemical and searches Google for any pages with embedded InChIs Requires Javascript enabled on browser ChemSketch Diarsipkan 2006 10 18 di Wayback Machine free chemical structure drawing package that includes input and output in InCHI format PubChem online molecule editor that supports SMILES SMARTS and InChI ChemSpider Services that allows generation of InChI and conversion of InChI to structure also SMILES and generation of other properties MarvinSketch Diarsipkan 2007 04 04 di Wayback Machine from ChemAxon implementation to draw structures or open other file formats and output to InChI file format BKchem Diarsipkan 2007 06 09 di Wayback Machine implements its own InChI parser and uses the IUPAC implementation to generate InChI strings CompoundSearch implements an InChI and InChI Key search of spectral libraries JNI InChI Java library that wraps the InChI library the Chemistry Development Kit uses JNI InChI to generate InChIs can convert InChIs into structures and generate tautomers based on the InChI algorithms Bioclipse generates InChI and InChIKeys for drawn structures or opened files Diperoleh dari https id wikipedia org w index php title International Chemical Identifier amp oldid 22225854