Stasiun Batavia merujuk pada stasiun kereta api aktif maupun nonaktif, serta merujuk pada halte trem nonaktif yang terletak di DKI Jakarta. Beberapa stasiun maupun halte yang menggunakan nama Batavia antara lain sebagaimana berikut:
Stasiun aktif sunting
- Stasiun Batavia-Benedenstad, merupakan nama lama dari Stasiun Jakarta Kota. Dibangun oleh perusahaan Staatsspoorwegen
- Stasiun Batavia-Koningsplein, merupakan nama lama dari Stasiun Gambir. Dibangun oleh perusahaan Nederlandsch-Indische Spoorweg Maatschappij
Stasiun dan halte nonaktif sunting
- Stasiun Batavia (NIS), merupakan stasiun kereta api nonaktif yang dibangun oleh perusahaan Nederlandsch-Indische Spoorweg Maatschappij. Stasiun ini disebut sebagai Stasiun Batavia Noord
- Stasiun Batavia (BOS), merupakan stasiun kereta api nonaktif yang dibangun oleh perusahaan Bataviasche Oosterspoorweg Maatschappij. Stasiun ini disebut sebagai Stasiun Batavia Zuid
- Halte Batavia, merupakan halte trem nonaktif yang dibangun oleh perusahaan Nederlands-Indische Tramweg Maatschappij