www.wikidata.id-id.nina.az
Halaman ini berisi artikel tentang genus bakteri Untuk istilah umum yang mencakup spesies di genus lain lihat Rhizobia RhizobiumRhizobium tropici on an agar plate Klasifikasi ilmiahKerajaan BacteriaFilum ProteobacteriaKelas AlphaproteobacteriaOrdo RhizobialesFamili RhizobiaceaeGenus RhizobiumFrank 1889Spesies tipeRhizobium leguminosarumSpesies 1 Lihat teks Rhizobium adalah genus bakteri tanah Gram negatif yang memfiksasi nitrogen Spesies Rhizobium membentuk asosiasi pengikat nitrogen endosimbiotik dengan akar kacang kacangan dan Parasponia Bakteri ini mengkolonisasi sel sel tumbuhan di dalam nodul akar di mana mereka mengubah nitrogen atmosfer menjadi amonia dan kemudian memberikan senyawa nitrogen organik seperti glutamina atau ureida ke tanaman Tanaman pada gilirannya menyediakan senyawa organik yang dibuat dengan fotosintesis untuk bakteri 2 Hubungan yang saling menguntungkan ini terjadi pada semua rhizobia di mana genus Rhizobium adalah contoh yang khas Daftar isi 1 Sejarah 2 Penelitian 3 Spesies 4 Filogeni 5 Referensi 6 Pranala luarSejarah suntingMartinus Beijerinck adalah yang pertama kali mengisolasi dan menumbuhkan mikroorganisme dari nodul kacang kacangan pada tahun 1888 Ia menamakannya Bacillus radicicola yang sekarang ditempatkan dalam Bergey s Manual of Determinative Bacteriology di bawah genus Rhizobium Penelitian suntingRhizobium membentuk hubungan simbiosis dengan tanaman tertentu seperti kacang kacangan memfiksasi nitrogen dari udara menjadi amonia yang bertindak sebagai pupuk alami untuk tanaman Penelitian saat ini sedang dilakukan oleh ahli mikrobiologi dari Agricultural Research Service untuk menemukan cara untuk memanfaatkan fiksasi nitrogen Rhizobium Penelitian ini melibatkan pemetaan genetik dari berbagai spesies rhizobia dengan spesies tanaman simbiotik masing masing seperti alfalfa atau kedelai Tujuan dari penelitian ini adalah untuk meningkatkan produktivitas tanaman tanpa menggunakan pupuk 3 Dalam biologi molekuler Rhizobium juga telah diidentifikasi sebagai pencemar dari kit pereaksi ekstraksi DNA dan sistem air ultra murni sehingga Rhizobium dapat muncul secara keliru di kumpulan data mikrobiota atau metagenom 4 Kehadiran bakteri pengikat nitrogen sebagai kontaminan mungkin karena penggunaan gas nitrogen dalam produksi air ultra murni untuk menghambat pertumbuhan mikrob dalam tangki penyimpanan 5 Spesies suntingRhizobium aegyptiacum Shamseldin et al 2016 Rhizobium aggregatum Hirsch and Muller 1986 Kaur et al 2011 6 Rhizobium alamii Berge et al 2009 Rhizobium altiplani Barauna et al 2016 Rhizobium alvei Sheu et al 2015 Rhizobium anhuiense Zhang et al 2015 Rhizobium azibense Mnasri et al 2014 Rhizobium azooxidifex Behrendt et al 2016 Rhizobium bangladeshense Harun or Rashid et al 2015 symbiovar trifolii symbiovar viciae Rhizobium binae Harun or Rashid et al 2015 Rhizobium calliandrae Rincon Rosales et al 2013 Rhizobium capsici Lin et al 2015 Rhizobium cauense Liu et al 2015 Rhizobium cellulosilyticum Garcia Fraile et al 2007 Rhizobium daejeonense Quan et al 2005 Rhizobium ecuadorense Ribeiro et al 2015 Rhizobium endolithicum Parag et al 2014 Rhizobium endophyticum Lopez Lopez et al 2010 Rhizobium etli Segovia et al 1993 7 symbiovar mimosae symbiovar phaseoli Rhizobium fabae Tian et al 2008 Rhizobium flavum Gu et al 2014 Rhizobium freirei Dall Agnol et all 2013 Rhizobium gallicum Amarger et al 1997 symbiovar gallicum 8 symbiovar orientale 9 symbiovar phaseoli 8 Rhizobium grahamii Lopez Lopez et al 2011 Rhizobium hainanense Chen et al 1997 Rhizobium halophytocola Bibi et al 2012 Rhizobium halotolerans Diange and Lee 2013 10 Rhizobium indigoferae Wei et al 2002 Rhizobium jaguaris Rincon Rosales et al 2013 Rhizobium kunmingense Shen et al 2010 Rhizobium laguerreae Saidi et al 2014 Rhizobium leguminosarum Frank 1879 Frank 1889 symbiovar trifolii symbiovar viciae Rhizobium lemnae Kittiwongwattana amp Thawai 2014 Rhizobium lentis Harun or Rashid et al 2015 Rhizobium leucaenae Ribeiro et al 2011 Rhizobium loessense Wei et al 2003 Rhizobium lusitanum Valverde et al 2006 Candidatus Rhizobium massiliae Greub et al 2004 Rhizobium mayense Rincon Rosales et al 2013 Rhizobium mesoamericanum Lopez Lopez et al 2011 Rhizobium mesosinicum Lin et al 2009 Rhizobium metallidurans Grison et al 2015 Rhizobium miluonense Gu et al 2008 Rhizobium mongolense Herr Baronn O Vonn Berkum et al 1998 9 Rhizobium multihospitium Han et al 2008 Rhizobium naphthalenivorans Kaiya et al 2012 Rhizobium oryzicola Zhang et al 2015 Rhizobium pakistanensis Khalid et al 2014 Rhizobium paranaense Dall Agnol et al 2014 Rhizobium petrolearium Zhang et al 2012 Rhizobium phaseoli Dangeard 1926 emend Ramirez Bahena et al 2008 Rhizobium phenanthrenilyticum Wen et al 2011 Rhizobium pisi Ramirez Bahena et al 2008 symbiovar trifolii 11 symbiovar viciae 11 Rhizobium pongamiae Kesari et al 2013 12 Rhizobium populi Rozahon et al 2014 Rhizobium qilianshanense Xu et al 2013 13 Rhizobium rhizogenes Riker et al 1930 Young et al 2001 Rhizobium rhizoryzae Zhang et al 2014 Rhizobium rosettiformans Kaur et al 2011 Rhizobium selenitireducens corrig Hunter et al 2008 Rhizobium smilacinae Zhang et al 2014 Rhizobium soli Yoon et al 2010 Rhizobium sophorae Jiao et al 2014 Rhizobium sophoriradicis Jiao et al 2014 Rhizobium straminoryzae Lin et al 2014 Rhizobium subbaraonis Ramana et al 2013 Rhizobium sullae Squartini et al 2002 Rhizobium tarimense Turdahon et al 2012 14 Rhizobium tibeticum Hou et al 2009 Rhizobium tropici Martinez Romero et al 1991 Rhizobium tubonense Zhang et al 2011 Rhizobium vallis Wang et all 2011 15 Rhizobium yanglingense Tan et al 2001 9 Rhizobium yantingense Chen et al 2015Filogeni suntingTaksonomi yang diterima saat ini berdasarkan List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature LPSN 1 dan National Center for Biotechnology Information NCBI 16 dan filogeninya berdasarkan LTP rilis 106 berbasis 16S rRNA oleh The All Species Living Tree Project 17 Rhizobium lusitanum Valverde et al 2006 Rhizobium rhizogenes Riker et al 1930 Young et al 2001 Agrobacterium rubi Hildebrand 1940 Rhizobium multihospitium Han et al 2008 Rhizobium tropici Martinez Romero et al 1991 Rhizobium miluonense Gu et al 2008 Rhizobium leguminosarum Frank 1879 Frank 1889 Approved Lists 1980 emend Ramirez Bahena et al 2008 18 Rhizobium endophyticum Lopez Lopez et al 2011 Rhizobium tibeticum Hou et al 2009 Rhizobium etli Segovia et al 1993 Rhizobium pisi Ramirez Bahena et al 2008 Rhizobium phaseoli Dangeard 1926 Approved Lists 1980 emend Ramirez Bahena et al 2008 Rhizobium fabae Tian et al 2008 Rhizobium hainanense Chen et al 1997 Arthrobacter viscosus Gasdorf et al 1965 19 Rhizobium alamii Berge et al 2009 Rhizobium mesosinicum Lin et al 2009 Rhizobium sullae Squartini et al 2002 Rhizobium indigoferae Wei et al 2002 Rhizobium gallicum Amarger et al 1997 Rhizobium yanglingense Tan et al 2001 Rhizobium mongolense Van Berkum et al 1998 Rhizobium oryzae Peng et al 2008 Rhizobium loessense Wei et al 2003 Rhizobium tubonense Zhang et al 2011 Rhizobium cellulosilyticum Garcia Fraile et al 2007 Rhizobium soli Yoon et al 2010 Neorhizobium galegae Lindstrom 1989 Neorhizobium vignae Ren et al 2011 Neorhizobium huautlense Wang et al 1998 Neorhizobium alkalisoli Lu et al 2009 Referensi sunting a b J P Euzeby Rhizobium List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature LPSN Diarsipkan dari versi asli tanggal 2012 05 23 Diakses tanggal 2012 05 02 Sawada H Kuykendall LD Young JM 2003 Changing concepts in the systematics of bacterial nitrogen fixing legume symbionts J Gen Appl Microbiol 49 3 155 79 doi 10 2323 jgam 49 155 PMID 12949698 Marvelous Microbe Collections Accelerate Discoveries To Protect People Plants and More Agricultural Research United States Department of Agriculture January 2010 Diakses tanggal 10 August 2018 Templat Cite biorxiv Kulakov L McAlister M Ogden K Larkin M O Hanlon J 2002 Analysis of Bacteria Contaminating Ultrapure Water in Industrial Systems Applied and Environmental Microbiology 68 1548 1555 doi 10 1128 AEM 68 4 1548 1555 2002 PMC 123900 nbsp PMID 11916667 NOTE This strain was formerly named Blastobacter aggregatus NOTE This species was formerly known as R leguminosarum sv phaseoli a b Amarger N Macheret V Laguerre G 1997 Rhizobium gallicum sp nov and Rhizobium giardinii sp nov from Phaseolus vulgaris nodules Int J Syst Bacteriol 47 4 996 1006 doi 10 1099 00207713 47 4 996 PMID 9336898 a b c NOTE R gallicum and R mongolense are 99 2 identical in their rDNA and may be the same species It has been proposed by Silva et al that R mongolense and R yanglingense be reclassified as R gallicum sv orientale Diange E A Lee S S 2013 Rhizobium halotolerans sp nov Isolated from Chloroethylenes Contaminated Soil Current Microbiology 66 6 599 605 doi 10 1007 s00284 013 0313 x PMID 23377488 a b Marek Kozaczuk M Leszcz A Wielbo J Wdowiak Wrobel S Skorupska A 2013 Rhizobium pisi sv trifolii K3 22 harboring nod genes of the Rhizobium leguminosarum sv trifolii cluster Syst Appl Microbiol 36 4 252 8 doi 10 1016 j syapm 2013 01 005 PMID 23507586 Kesari V Ramesh A M Rangan L 2013 Rhizobium pongamiae sp nov From Root Nodules of Pongamia pinnata BioMed Research International 2013 1 9 doi 10 1155 2013 165198 Xu Lin Zhang Yong Deng Zheng Shan Zhao Liang Wei Xiu Li Wei Ge Hong 2013 Rhizobium qilianshanense sp nov a novel species isolated from root nodule of Oxytropis ochrocephala Bunge in China Antonie van Leeuwenhoek 103 3 559 565 doi 10 1007 s10482 012 9840 x Turdahon M Osman G Hamdun M Yusuf K Abdurehim Z Abaydulla G Abdukerim M Fang C Rahman E 2012 Rhizobium tarimense sp nov isolated from soil in the ancient Khiyik river of Xinjiang China Int J Syst Evol Microbiol 63 Pt 7 2424 9 doi 10 1099 ijs 0 042176 0 PMID 23203621 Fang Wang En Tao Wang Li Juan Wu Xin Hua Sui Ying Li Jr amp Wen Xin Chen 2011 Rhizobium vallis sp nov isolated from nodules of three leguminous species Int J Syst Evol Microbiol 61 11 2582 2588 doi 10 1099 ijs 0 026484 0 PMID 21131504 Sayers et al Rhizobium Agrobacterium group National Center for Biotechnology Information NCBI taxonomy database Diakses tanggal 2012 05 02 All Species Living Tree Project 16S rRNA based LTP release 106 full tree PDF Silva Comprehensive Ribosomal RNA Database Diarsipkan dari versi asli PDF tanggal 2012 05 07 Diakses tanggal 2012 05 02 This is the type species for the genus Arthrobacter viscosus sekarang diklasifikasikan dalam Micrococcaceae Lihat Arthrobacter Pranala luar suntingCurrent research on Rhizobium leguminosarum at the Norwich Research Park Video and commentary on root nodules and Rhizobium in White Clover nbsp Wikimedia Commons memiliki media mengenai Root nodules Diperoleh dari https id wikipedia org w index php title Rhizobium amp oldid 24238639