Sungai Minnesota ialah sungai di Amerika Serikat. Ada di utara AS, di negara bagian Minnesota. Merupakan anak sungai Sungai Mississippi. Panjangnya 534 km.
Sumber sungai ini ialah danau di Minnesota. Danau itu disebut Big Stone Lake. Danau itu merupakan perbatasan antara negara bagian Minnesota dan Dakota Selatan. Dari sumbernya, Minnesota mengalir ke tenggara. Di Mankato, berbelok ke timur laut. Bergabung dengan Mississippi tepat di selatan kota Saint Paul dan Minneapolis.
Sungai Minnesota terbentuk setelah zaman es akhir di Amerika Utara.