Pegunungan Jura adalah pegunungan kecil yang terletak di sebelah utara Alpen, memisahkan sungai Rhine dan Rhone. Pegunungan ini terletak di Prancis, Swiss dan Jerman.
Di Prancis, pegunungan ini meliputi wilayah Franche-Comté, membentang ke selatan ke wilayah Rhône-Alpes di sebelah timur departemen Ain, di mana pegunungan ini mencapai puncaknya di Le Crêt de la Neige. Ujung selatan pegunungan ini adalah barat laut dari departemen Savoie. Ujung utara pegunungan ini adalah Elsas selatan.