Berikut merupakan Daftar Bupati Baucau dari masa ke masa.
| No | Foto | Nama | Mulai jabatan | Akhir jabatan | Keterangan |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | Abel da Costa Belo | 1976 | 1982 | Bupati Kepala Daerah Tk.II Baucau | |
| 2 | Kolonel I. Gusti Ngurah Oka. | 1982 | 1987 | Bupati Kepala Daerah Tk.II Baucau | |
| 3 | Herman Sediono | 1988 | 1992 | Bupati Baucau | |
| 4 | Virgílio Maria Dias Marçal | 1992 | 1999 | Bupati Baucau |